第5回ジンベエザメ国際会議

5月下旬に世界遺産であるオーストラリア・ニンガルーコーストにあるエクスマスという街でジンベエザメ国際会議に参加してきました。

香港経由でパース空港に深夜に到着

そのまま空港のSleeping podで快適に就寝

行きのパース～エクスマスの機内、右手にずっと見えていたのは赤茶けた台地

エクスマス Exmouthという街では、ジンベエザメは非常に身近な存在

 

学会参加者全員に配られるグッズ　

ペットボトルが要らないようにマイボトル（会議ロゴ付き）、

そして、写っていないけど、金属製のストローも

自然保護に関係する地元企業や政府機関、そして関係ない企業も分厚く協賛　

おかげで整った清潔感のある会場

なんだか頭が「エラスモ」だから道に落ちてるこんなものも、

アレに見えてくる！でも実は植物

 

会議中の半日は地元のエコツーリズム体験

  

船上からザトウクジラ、そしてハンドウイルカが3つ巴で見えたり

海水面にだらんとしたウミヘビ

シュノーケリングでスティングレイも見ることができたけど、

やはり主役は

ジンベエザメ！

我々のボートの近くに計5匹が来ていたらしい

 

けど、慣れないシュノーケリング、ついていくのがやっとで

雌雄の違いや模様による個体の識別なんてしている余裕はないけど

なんとかムービーで撮影

接近は3メートルまでと決められている

 日本からの他の参加者はみな知り合いで、海外からも一緒に仕事したことのある仲間が
初めて参加したこの会で、昨年秋に発表したゲノム解析について紹介　
ある意味、馴染みのないコミュニティを相手にするのは慣れています

 会議後はメルボルンへ移動し、共同研究者とのタイトなミーティング x2

その前に地元の水族館へ　ドイツ時代で世話になったSea Life系列

 

おきまりのサメ卵付きのタッチプール

これはポートジャクソンネコザメ

これはゲノム研究者にはおなじみ、ゾウギンザメ

これは実物を始めて目にしました

draughtboard shark (Cephaloscyllium laticeps)のもの

最も大きな水槽の目玉は、やはり板鰓類

 シロワニ、トラフ、ツマグロ、ヤジ、コモリ、オオテンジクなど定番に加え、

ガンジスメジロザメ Glyphis glyphis

 そして、さっきの植物じゃなくて、ほんもの

Largetooth sawfish ノコギリエイの一種

オスメス両方いたが、メスのほうが全長もノコギリ長も大きいとか

その場にいた従業員が快く教えてくれた

メルボルンからの用務を無事終えて、最後大雨の中なんとか空港に到着

ロングフライトを控えてずぶぬれで空港へ、ってのは初めての経験でした

日本に戻り、学会参加グッズのメタルストローを試用。そういえば学会中立ち寄ったB級イタリアンレストランも紙ストローでした。もうプラ廃止の流れは当然で、日本が遅いだけと改めて痛感。今回の会議にて、美ら海チーム（私の共同研究者でもあります）は、水族館での診断に基づく知見と、そのスキルを活用したガラパゴスでの野外調査（プレスリリース、水族館ブログ記事）について発表。私見では、これらの発表に刺激を受けて、これまで水族館でのジンベエ飼育に肯定的でなかった海外の関係者が、水族館での飼育を通した研究の重要性を認識する機会となったようである。あと、私自身はとくに世界の野外ジンベエ集団の現時点での知識を始めて整理することができ、同時にDNA解析全般の現状も確認できました。今後の関わり方を検討していきます。

さいごに、系統樹マンダラ【サメ編】の制作に取り組んでいます。実現のためのクラウドファンディングにご支援いただけると非常に有難いです。 50種ほどのイラストがポスターに入るのですが、ジンベエザメが入るか、というと・・・。そこのところはぜひお楽しみに！

ウミヤツメゲノムコンソーシアム（１）

そういえば、まだ神戸にいた２００５、６年ごろから、旧式のサンガーシーケンサによるウミヤツメゲノムの配列データが出始めたことを把握していたのだった。あの頃は、ハードコアな実験生物学者に囲まれて、独りでゲノム情報を扱っており、新たな配列データベースやゲノムリソースの情報を自分でどこから得ていたのか、もう覚えていない。

それから・・・・、２年ほど経ったころ、私はドイツの田舎の大学のオフィスで、そこそこつながったウミヤツメゲノム配列が手に入ることを知り、おもむろに解析を始めたと記憶している。渡独して間もない時期だったので、異国での生活だけでなく学部の講義などもまだおぼつかない頃である。このとき扱っていたのは、Version 3と呼ばれたアセンブリである。おそらく私の研究キャリアの中で最も興奮しながら扱ったゲノムアセンブリであろう、これからどんな生き物のゲノムを扱うとしても。

当時は、その「アセンブリ」がどのようにして、そして誰によって構築されたかは全くしらなかった。ゲノムプロジェクトが通常どのように行われるかも知らなかったはずだ。それでも、作られたアセンブリは、数々の既存のツールで「遊ぶ」には格好の材料であった。GenScanも、RepeatMaskerも、BLASTも、自分でセットアップしたワークステーションの上で、何度も何度も走らせた。有給の学生研究補助の制度（HiWi）を使って、プログラミングに長けた学生に、AugustusをTraining（この「AL5」と呼んだTraining条件は現在、Augustusサーバー・プログラムにおいて利用できる）してもらい、より確かにコード領域を推定できるようにして、ゲノムワイドな遺伝子セットを用意した。

こんな感じで時間が少し経ったころ、このゲノムプロジェクトを推進する中心的立場を担っているという研究者に進捗などをメールで尋ねることにした。このプロジェクトには、珍しくWhite Paperなるものが存在しなかった。進捗を尋ねるのに、誰に連絡したらよいかも、最初は容易にわからなかったと記憶している。ここで、予想できたのは、すでに名だたる研究者たちがこのゲノムのアノテーションを行っていて、ほどなく解析結果が公表されてしまうという状況であった。そうなれば、私のチームの努力は無駄になるのであるが、なんだかそんなことはどうでもよかった。自分の手でゲノムを「解いて」、その結果に思いを巡らす経験をすることそのものが財産である、ということを強く感じながら進めていたのをいまでも覚えている。誰が解析しても見つけられないものを自分なら見つけられる、と思っていたわけでは決してない。

メールでやりとりを少ししたあと、その研究者と電話で話そうということになった。これから解析を始めるところだから、ぜひ解析や議論に参加してほしい、ということであった。もともと、ヤツメのゲノムを解析することが専門だと知れた研究者など、いるわけはなかった（たぶん）。今思えば、少しでも、ヤツメの面白さや、この生き物についてこれまでどのような研究が行われてきたかを把握している人に加わって欲しいと思っていたに違いない。さらに、彼本人が内分泌学者であるから、ゲノムインフォマティクスに少しでも近く、それでいて、他の生物ではなく、このヤツメのゲノム解析に注力してくれる人を巻き込むことで、自分への負担を軽くしたかった、という思惑もあったであろう。私はベストフィットな人間ではなかったが、少しでもそれに近いと思ってくれたようで、彼の所属先で行うコアミーティングに参加してほしい、ということになった。

（続く）


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